Мне кажется, такой глюк случался у всех. Всегда советовали либо общий сброс, который почти не помогал, либо прошить фс, что неудобно - приходится заново заливать драйвера и т.д.; либо какие-то неопределенные манипуляции с многократным перезапуском телефона. Я разобрался, что в этом случае делать.
1) Во-первых, надо освободить на телефоне место.

2) Раздвоившееся приложение надо несколько раз переместить на телефон,так как появляется ошибка, достаточно всегда 3х раз. Когда оно переместится, раздвоение исчезнет. Обязательно перемещайте его на карту.
Тут важно заметить, что на телефоне в папке tpa/preset/system/ams остаются копии файлов(от 2 до 4). Их надо удалить(либо через телефон - java-файлменеджером с патчем на полный доступ в фс, либо через комп - через Far или XS++) - все файлы с именем приложения и еще символами, они все равно не используются.

3) Если приложение "расчетверилось", надо так же 3 раза переместить его на телефон - один файл исчезнет, затем удалить один файл, и опять 3 раза переместить на телефон. Потом тоже обязательно перемещайте его на карту.
В папке tpa/preset/system/ams опять остаются копии файлов, только теперь в 3х экземплярах(каждый).

P.S. Если появится ошибка, что не хватает места - очистите память и удалите из папки tpa/preset/system/ams все файлы с именем приложения и еще символами, они все равно не используются.

by devilian